Метронідазол успішно застосовується для лікування анаеробних інфекцій органів грудної клітки, голови, шлунково-кишкового тракту та сечостатевої системи, а також анаеробної септицемії та бактеріємії.
Препарат активний щодо Trichomonas vaginalis, Gardnerella vaginalis, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica, облігатних анаеробних бактерій: Bacteroides spp.
Метронідазол показаний для лікування гострого кишкового амебіазу (амебної дизентерії) та абсцесу печінки, спричиненого амебами. При лікуванні метронідазолом абсцесу печінки, викликаного амебами, не виключена необхідність аспірації або дренування гною. Анаеробні бактеріальні інфекції.