У робочі дні їх два: з 07:30 до 10:30 та з 17:30 до 20:30. А у суботу, неділю та свята піковим вважається інтервал з 13:00 до 18:00. Загалом графік МЦК збігається з графіком метро – кільце відкрито для пасажирів з 05:30 до 01:00.
МЦД працює так само, як метро та МЦК: щодня з 5:30 ранку до 1:00 ночі. Поїзди ходять кожні 12-15 хвилин – у майбутньому планується скоротити інтервали в години пік. Зі станцій МЦД можна пересісти на метро, МЦК чи наземний транспорт.
Загалом графік роботи МЦК частково збігається з графіком роботи метрополітену – платформи відкриті для пасажирів з 05:30 до 00:25-01:00. Рух поїздів із пасажирами здійснюється з 5:45 до 1:10. Поїзди зупиняються біля високих острівних та берегових платформ у режимі метро по всіх пунктах.