Пацієнт збирає сечу при вільному сечовипусканні в суху, чисту ємність з широким горлом, перемішує і відбирає в спеціальний медичний контейнер з кришкою, що загвинчується, в об'ємі не більше 50-100 мл. Збір сечі проводять після ретельного туалету зовнішніх статевих органів без застосування антисептиків.
Для взяття сечі кілька мілілітрів сечі слід спустити в унітаз, потім, не перериваючи струменя, слід направити її в контейнер, заповнивши склянку на три чверті. Потім можна закінчити сечовипускання в унітаз. Після збору сечі слід щільно закрити контейнер кришкою.
Необхідно збирати сечу після ранкового сечовипускання. Сеча, зібрана під час ранкового сечовипускання, для даного дослідження, не використовується. Клітини, які залишалися всю ніч у сечовому міхурі, можуть руйнуватися.
Пацієнт починає мочитися в унітаз (або ємність), потім, не перериваючи сечовипускання, продовжує у другу ємність, закінчує в третю ємність або унітаз. Переважною за обсягом має бути друга порція. Зібрану середню порцію сечі (20-25 мл) одразу доставляють до лабораторії.