Вечеря називається "таємницею", т. до. відбувалася приховано від юдеїв, які бажали вбити Христа (Мт. 26:4).
Найбільш обговорюваним секретом фрески є постать учня, що розташувався праворуч від Христа. Вважається, що це не хто інший, як Марія Магдалина та її місцезнаходження вказує на той факт, що вона була не коханкою Ісуса, як це заведено вважати, а його законною дружиною.
Варфоломій, Яків Алфєєв та Андрій; Юда Іскаріот (в одязі зеленого та блакитного кольорів), Петро та Іван; Яків Зеведеєв, Хома та Філіп Матфей, Юда Фаддей та Симон.
Ряд мистецтвознавців та біблійних учених насправді вважають, що людина праворуч від Ісуса на картині – жінка, що найімовірніше є Марією Магдалиною. Це єдина людина на картині, що носить намисто або кулон.