Амінокислоти утворюються при розпаді білків м'язів та сполучної тканини, їх включення в глюконеогенез відбувається при тривалому голодуванні або тривалому фізичному навантаженні. У рослин, дріжджів та багатьох бактерій є шлях, що дозволяє отримувати вуглеводи з жирних кислот – гліоксилатний цикл.
Глікогеногенез відбувається у всіх тканинах тварин, проте в основному він має місце в печінці та м'язах. Синтез глікогену відбувається у період травлення (в абсорбтивний період, тобто 1-2 години після прийому вуглеводної їжі).
Протягом порівняно коротких періодів голодування печінка виробляє та вивільняє глюкозу в кровотік за рахунок розщеплення запасів глікогену. Тим не менш, у міру вичерпання запасів глікогену печінка починає підтримувати рівень глюкози у плазмі крові при допомоги глюконеогенезу.