Паразитуючи в слизовій оболонці шлунка, Helicobacter pylori призводить до її повільного руйнування. Спочатку інфекція провокує поверхневий ерозивний гастрит (невеликі та неглибокі виразки на слизовій оболонці шлунка), потім може спричинити виразку (глибоке руйнування стінки шлунка) або хронічний гастрит.
Гастрит належить до легших захворювань, ніж виразка.
У разі гастриту больові відчуття зазвичай проявляються після приймання їжі приблизно через 3-4 години. У разі виразки ж больові відчуття виникають відразу ж або не пізніше ніж через годину. При цьому часто одними болями не обмежується і з’являється нудота і навіть блювота.