До смерті Ахмеда I у 1617 році Мустафа був ув'язнений у палаці в т.з. Кафесе (клітині) — невеликий павільйон (кешка) на території султанського палацу, в якому шехзаде знаходився в ізоляції від зовнішнього світу під постійним наглядом варти.
Сулейман повірив, що його життю загрожує небезпека, і наказав стратити свого сина. Коли Мустафа увійшов у намет батька, щоб зустрітися з ним, охорона Сулеймана оточила султанський намет, щоб опальний спадкоємець престолу не зумів врятуватися. У результаті в ході бою з німими катами Мустафа був убитий Залом Махмудом – агою.
Все своє недовге правління Мустафа був лише пішаком у руках придворних. Фактично країною керували великий візир Дамат Халіл-паша та валіді Халіме Султан. У 1618 році інша придворна фракція скинула Мустафу І звела на трон його племінника Османа II.
У якій серії турецького серіалу «Чудовий вік» стратять Мустафу? Наша відповідь: Це сталося в 4-му сезоні, 20-й серії (або 123-й із загальної кількості серій). У цьому епізоді Селім і Мустафа вирушають до військового табору за наказом Сулеймана.