При контакті хворого з алергеном у його організмі починають вироблятися спеціальні антитіла (IgE). Ці антитіла абсорбуються на поверхні різних запальних клітин, таких як гладкі клітини та базофільні гранулоцити. Такі клітини знаходяться, наприклад, у слизовій оболонці дихальних шляхів, крові та шкірі.
Не лікувати алергію взагалі — загрожує прогресуванням захворювання та появою ускладнень. Наприклад, алергічний нежить може ускладнитись гайморитом, або при неадекватному лікуванні – перейти в бронхіальну астму.
При харчовий алергії може підвищуватися рівень еозинофілів – лейкоцитів (білих кров'яних клітин), які беруть участь у алергічних реакціях за рахунок вивільнення біологічно активних речовин, наприклад, гістаміну. Визначення кількості імуноглобулінів Е у крові.