Серед клітинних органел можна виокремити одне ядро, одну скорочувальну вакуоль і безліч травних вакуолей, а також гранул запасних речовин (різних полісахаридів, ліпідних крапель, численних кристалів).
У звичайної амеби, як і в більшості тварин, у цитоплазмі розташоване лише одне ядро. Однак у деяких найпростіших може бути 2 (наприклад, в інфузорії-туфельки) і більше ядер. Ядра інфузорії називаються макронуклеус (або вегетативне ядро) і мікронуклеус (генеративне).
У стані спокою в радіолярії одне ядро, їм притаманні два типи – первинні та вторинні ядра.
Будова амеби : Амеба протей (Amoeba proteus) (мал. 1) мешкає в прісних водоймах. Досягає в довжину 0,5 мм. Має довгі псевдоподії, одне ядро, оформленого клітинного рота і порошиці немає.