Харчові отруєння мікробного походження – це захворювання, що настає в результаті вживання їжі, що містить значну кількість живих клітин збудників різних захворювань (стафілакок, кишкова паличка, протей, ботулізм паличка).
Виділяють 3 групи харчових отруєнь: мікробні (викликані бактеріями, їх токсинами, грибами) немікробні (отруйними грибами та рослинами, отруйними продуктами тваринного походження, хімічними сполуками) невстановленої етіології (зв'язок із харчуванням доведено, але що конкретно викликало отруєння – Невідомо).
Причиною харчовий токсикоінфекції є не стільки самі мікроби, скільки токсини – отруйні речовини, що утворюються в результаті життєдіяльності цих мікробів та при їх руйнуванні. В організм людини з їжею можуть потрапити різні бактерії – стрептококи, стафілококи, протей, ентерококи та низка інших.